Guarida del Team Rocket: En la Tienda de Recuerdos de Pueblo Caoba se encuentra la Guarida Team Rocket. Descubrirás la entrada con ayuda de Lance una vez vuelvas del Lago de la Furia. Parece que de esta tienda provienen las ondas malignas que impiden escuchar la Radio del PokéGear en toda la zona.
Además, mientras no derrotes al Team Rocket por completo tanto en la Guarida Team Rocket como en la Torre Radio de Ciudad Trigal, no podrás avanzar hacia Ruta 44. Una vez obtengas 7 medallas de Gimnasio este mensaje cambiará, anunciando la vuelta del Team Rocket.
Sistema de Seguridad Persian: En el primer piso de la Guarida Team Rocket se han instalado diversos sistemas de seguridad. Uno de ellos es el Sistema de Seguridad Persian, y consiste en 5 estatuas con forma de Persian.
Cuando pases delante de una de estas estatuas, se encenderá una alarma y dos Soldados del Team Rocket aparecerán para retarte. La primera estatua es inevitable, pero puedes evitar el resto de batallas desactivando el sistema de seguridad en el ordenador del centro de la sala (el mismo ordenador te permite reactivarlo luego si quieres entrenarte contra los guardas). Estos dos guardas siempre son los mismos:
Trampa Pokémon: El otro sistema de seguridad del primer piso consiste en una zona llena de trampas ante cuya activación se produce la aparición de un Pokémon salvaje.
Hay tres tipos de trampas distintas, que dan lugar a los siguientes Pokémon salvajes:
Contraseńas de Acceso: En el segundo piso te encontrarás con Lance, que sanará a tus Pokémon. El acceso al generador de ondas malignas está bloqueado por una enorme puerta que sólo se abre con la voz del Ejecutivo Petrel. Este Ejecutivo se encuentra en el tercer piso.
En el tercer piso Lance te informa de que Petrel se encuentra en su despacho, bajo un sistema de doble contraseńa. Estas contraseńas las conocen los dos Soldados del piso (ColaSlowpoke y ColaRaticate). Sube por las escaleras de arriba y vuelve al tercer piso por el noroeste para encontrarte con el Ejecutivo Petrel:
Una vez derrotado, Petrel te cuenta la contraseńa (Viva Giovanni), pero también que sin su voz no sirve de nada. Sale huyendo, y es entonces cuando su Murkrow repite la contraseńa con una voz idéntica a la de Petrel. Sigue al Murkrow hasta la puerta del generador.
El Generador de Ondas Malignas: Con la ayuda de Murkrow logras acceder a la sala del generador. Pero antes de que puedas hacer nada, otra Ejecutiva del Team Rocket sale a tu encuentro, esta vez acompańada de un Soldado. Lance decide entonces intervenir y ayudarte en la última batalla contra la Ejecutiva Atenea:
Una vez derrotados, Lance se dispone a desactivar el generador de ondas malignas. Como no hay interruptor, deberéis ir a la fuente de energía, derrotando o capturando a los seis Electrode que generan su electricidad. Cada uno os encargaréis de tres de ellos:
Una vez derrotado el Team Rocket en su guarida de Pueblo Caoba, Lance te agradece tu ayuda entregándote la MO05, que contiene el movimiento Torbellino. Sin embargo, ahora las ondas malignas parecen haberse extendido a todo Johto desde la Torre Radio de Ciudad Trigal.
Objetos de Guarida Team Rocket en Pokémon Oro HeartGold y Plata SoulSilver